Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms