Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AlkP97793 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AlkP97793 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AlkP97793 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AlkP97793 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AlkP97793 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AlkP97793 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AlkP97793 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AlkP97793 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms