Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cmklr1P97468 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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