Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms