Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf6P70279 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms