Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps18P62270 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps18P62270 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms