Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp46P62069 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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