Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms