Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms