Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41l4aP52963 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms