Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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