Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TspoP50637 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms