Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms