Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pbx1P41778 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pbx1P41778 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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