Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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