Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms