Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfraP26618 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfraP26618 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfraP26618 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfraP26618 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms