Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tap1P21958 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms