Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms