Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms