Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms