Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms