Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms