Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms