Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt8P11679 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt8P11679 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt8P11679 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt8P11679 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt8P11679 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt8P11679 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt8P11679 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt8P11679 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms