Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prf1P10820 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms