Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms