Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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