Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PdgfrbP05622 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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