Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XlrP05531 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XlrP05531 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XlrP05531 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XlrP05531 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms