Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01648 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01648 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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