Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DcxO88809 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DcxO88809 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DcxO88809 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DcxO88809 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms