Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lnx1O70263 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms