Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn5O54942 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn5O54942 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn5O54942 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn5O54942 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn5O54942 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn5O54942 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn5O54942 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn5O54942 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn5O54942 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn5O54942 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn5O54942 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn5O54942 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn5O54942 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn5O54942 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn5O54942 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms