Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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