Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptlc1O35704 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms