Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih1O35372 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms