Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2O35245 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2O35245 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms