Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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