Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms