Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms