Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20825J3QM67 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20825J3QM67 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms