Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8247F6VRJ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm8247F6VRJ8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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