Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngap1F6SEU4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms