Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms