Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aknad1E9Q8N6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms