Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms