Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms