Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms