Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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